GeneCards
GeneCards is een vrij toegankelijke databank waarin duizenden ontdekte en voorspelde menselijke genen zijn geïndexeerd.[1] De gegevens zijn afkomstig uit genomische, proteomische, transcriptomische onderzoeken.[2] GeneCards is ontwikkeld en wordt onderhouden door het Crown Human Genome Center van het Weizmann Instituut van Wetenschappen (WIS). De database is bedoeld om een snel overzicht te geven van de huidige beschikbare biomedische informatie over het (voornamelijk menselijke) genoom, de gecodeerde eiwitten en relevante erfelijke ziekten.[1]
| GeneCards | ||||
|---|---|---|---|---|
| Type | databank | |||
| Taal | Engels | |||
| Eigenaar | Crown Human Genome Center, WIS | |||
| Status | actief | |||
| Link | Officiële website | |||
| ||||
De GeneCards-database biedt toegang tot meer dan zevenduizend menselijke genen. Deze zijn geïntegreerd vanuit ruim negentig gegevensbronnen, waaronder HGNC, Ensembl en NCBI. Alle informatie in GeneCards is geselecteerd uit deze databases door de krachtige en gebruiksvriendelijke engine. De belangrijkste genen zijn gebaseerd op de richtlijnen vastgesteld door de HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC).[3]
In de loop van de tijd heeft de GeneCards-database een reeks tools ontwikkeld (GeneDecks, GeneLoc, GeneALaCart) om meer gespecialiseerde mogelijkheden te bieden. Sinds 1998 wordt de GeneCards-database op grote schaal gebruikt voor onderzoek in de bio-informatica, systeembiologie en geneeskunde.[4]
Zie ook
bewerkenExterne link
bewerkenBronnen
- ↑ a b (en) Rebhan M, Chalifa-Caspi V, Prilusky J, Lancet D (1997). GeneCards: integrating information about genes, proteins and diseases. Trends Genet. 13 (4): 163. PMID 9097728. DOI: 10.1016/S0168-9525(97)01103-7.
- ↑ (en) Rebhan M, Chalifa-Caspi V, Prilusky J, Lancet D (1998). GeneCards: a novel functional genomics compendium with automated data mining and query reformulation support. Bioinformatics 14 (8): 656–64. PMID 9789091. DOI: 10.1093/bioinformatics/14.8.656.
- ↑ (en) Safran M, Dalah I, Alexander J, Rosen N, Iny Stein T, Shmoish M, Nativ N, Bahir I, Doniger T, Krug H, Sirota-Madi A, Olender T, Golan Y, Stelzer G, Harel A, Lancet D (2010). GeneCards Version 3: the human gene integrator. Database 2010: baq020. PMID 20689021. PMC 2938269. DOI: 10.1093/database/baq020.
- ↑ (en) Stelzer G, Dalah I, Iny Stein T, Satanower Y, Rosen N, Nativ N, Oz-Levi D, Olender T, Belinky F, Bahir I, Krug H, Perco P, Mayer B, Kolker E, Safran M, Lancet D (2011). In-silico Human Genomics with GeneCards. Human Genomics 5 (6): 709–717. PMID 22155609. PMC 3525253. DOI: 10.1186/1479-7364-5-6-709.